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与那国岛 Yonaguni-jima
八重山群岛的最西边，也就是日本最西端的与那国岛，可隔海望到台湾岛。1986 年当地的潜水者新嵩喜八郎先生在这里发现了海底遗迹，成为与那国具有代表的遗迹景点之一，目前为止这到底是自然形成，还是人工创造都还是个迷。
冲绳本岛
本岛的潜水点主要分布于西海岸沿岸地区，许多地方可以直接从海滩进入潜水景点，周边的潜水店铺也有许多，只是尽量提前预定，由于本岛的交通最为方便，所以人也自然很多。本岛最知名的潜点就有青之洞窟、古洞和沉船潜水。
久米岛 Kume-jima
久米岛是位于冲绳那霸市以西90 公里处的火山岛，岛上多山，南侧是绵延五公里的珊瑚礁沙洲 “终端海滨”,。岛屿的北侧是壮观的海底断崖，南侧则是连绵不断治愈般的白色沙滩，形成鲜明的对照。这里的主要潜水区域都集中在北部地区，主要是以看锤头鲨和海浪风暴而出名。另外还有一个类似青洞的洞穴值得一潜。
庆良间群岛 Kerama Islands
庆良间诸岛位于那霸以西30~40 公里海面上，在冲绳主岛和久米岛之间，由20 多个大小岛屿构成。
这里作为潜水区域历史已经很久，有人居住的岛上就有潜水商店，周围已经开发出大约有100 多个潜水点，这里的潜点完全是靠船潜完成，通常船程都在5—30 分钟时间。
其中渡嘉敷、座间味、阿嘉、庆留间四个岛屿是有人岛，其余均为无人岛。其中渡嘉敷岛是最大的岛屿，也是离的最近的岛屿，从那霸乘快艇只要35 分钟就可到达。
八重山群岛 Yaeyama Islands
八重山群岛位于冲绳本岛东南约450 公里处，距离台湾岛非常近，从台北去八重山甚至比去垦丁还方便。由石垣岛、西表岛、竹富岛、黑岛、小滨岛、波照间岛、与那国岛等岛屿构成。
这里潜点非常繁多，总数超过100 个，其中几乎100% 能遇见蝠鲼的石垣岛周边就拥有30 个以上的潜点。目前覆盖森林的西表岛、拥有美丽珊瑚的黑岛和日本最南端的有人岛波照间岛等都还在开发中，某些时段还不允许登岛，不过潜水不受影响。
宫古岛 Miyako-jima
宫古岛潜点主要分布在西侧，以拱型和洞窟地型而知名，其周围虽然也有珊瑚和各种大鱼群，但比起那些洞穴来说就不算特点了。周围最著名的三个洞穴是双拱形岩石、魔王宫殿和高迪洞，特别是最后这个潜点，因为其洞穴形态颇有西班牙建筑师高迪的作品风格而得名。
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